biochimie et biotechnologies
Accueil --- Préambule --- Cellule --- Biochimie-Matériaux --- Protéines --- Protéomique --- Enzymes --- Biologie-moleculaire & Génie génétique --- Visualisation-moléculaire-JMOL-Rastop --- Biotechnologies-applications --- Techniques --- Takween supports --- Biochimie. Downloads Fr, Ar, Eng --- QCM-exercices-examens ----- Concours de Pharmacie --- Sciences-Vie-Biochimie-transition-(Ar) ---- Liens-utiles --- Annonces --- Newsletter --- E-books --- Lexique Fr, Ar, Eng -

Molécules et enzymes de la glycolyse. Visualisation 3D par JMOL

جزيئات هدم الكليكوز. معاينة في البعد الثالث

La glycolyse prend lieu dans le cytoplasme de la cellule et transforme le glucose en acides pyruvique. Il y'a des étapes consommatrices d'énergie (ATP) (activation du glucose par phosphorylation) et des étapes libératrices d'ATP).

La visualisation en 3D par JMOL des molécules et enzymes de la glycolyse permet de contribuer à la compréhension de la production de l'énergie par la cellule.


Liens utiles: -- Glycolyse et production d'énergie dans les programmes du secondaire -- Glycéraldéhyde-3-Phosphate Déshydrogénase (GPDH) --

Sur la même page: Glucose (hexose) --- Fructose-6-Phosphate --- Glucokinase complexée avec Glucose --- Pyruvate ---

 ما هي أهم مراحل انحلال الكليكوز داخل الجبلة الشفافة و ظهور حمض البيروفيك - Acide pyruvique

-         تنشيط الكليكوز في شكل فروكتوز 1، 6- ثنائي الفوسفاط و الذي سينشطر إلى جزيئين من سكر ثلاثي الكاربون مفسفر.

-  أكسدة جزيئا السكر ثلاثي الكاربون المفسفر إلى جزيئين من حمض البيروفيك. و تستعمل الطاقة المحررة من هذه الأكسدة في فسفرة ADP إلى ATP. تفاعل اكسدة اختزال (Oxydoréduction) هو عبارة عن إزالة الهيدروجين (Déshydrogénation)، و يتطلب مستقبل للهيدروجين و هو NAD+ (Nicotinamide Adénine Dinucléotide) الذي يختزل في صفة NADH  (+ H+) و الذي يعتبر كطاقة اختزالية للخلية (Pouvoir réducteur)، بينما يتأكسد سكر ثلاثي الكربون (يفرغ من 2 H+ و 2 e- ). المزيد من المعلومات  في كتاب علوم الحياة - بيوكيمياء 

Avertissement: la visualisation des molecules par JMOL nécessite l'installation de java (http://www.java.com). Si problème aciver java pour votre navigateur. Instructions- تعليمات


Glycolyse


Livre 'Sciences de la vie. Protéines et Enzymes' (+ DVD), Baaziz, 2013: QCM corrigés, Exercices corrigés, Contrôles corrigés en Biologie cellulaire et Biochimie pour S1, S3, S4 et S5.

Protéines et Enzymes, Baaziz 2013


C'est le glucose qui est le premier acteur dans la glycolyse et la production d'énergie sous forme d'ATP (pat du catabolisme dans le métabolisme).


Glucose كليكوز

La glycolyse se déroule dans le cytoplasme et aboutit à la formation de deux molécules de pyruvate (3 carbones) à partir d'une seule molécule de glucose (6 carbones). Le bilan global de la glycolyse est :

Glucose + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD+ ----> 2 pyruvate + 2 ATP + 2 H2O + 2 NADH

La glycolyse comprend deux étapes principales dont 1/ La phosphorylation (consommatrice d'énergie) et 2/ La déshydrogénation ou oxydation s'accompagnant de la production d'énergie sous forme d'ATP.

Le glucose sera d'abord phosphorylé par fixation du phosphate sur son carbone N° 6. Il en résulte le Glucose 6-phosphate. La glucokinase (ou hexokinase) joue un rôle capital. Le glucose-6-P est ensuite transformé en Fructose 6-P qui est phospholylé une deuxième fois sur son carbone 1 pour donner le Fructose-1,6-diphosphate (voir schéma de la glycolyse).



Fructose-6-phosphate فريكتوز 6-فوسفاط

Pendant la glycolyse, le fructose-6-phosphate est phosphorylé en Fructose-1,6-diphosphate (Fru-1,6-DP) par la phosphofructokinase-1 en utilisant une molécule d'ATP qui est convertie en ADP. Cette consommation d'énergie rend cette étape irréversible, et constitue un point de régulation de la vitesse de la glycolyse (voir schéma de la glycolyse).


L'hexokinase ou glucokinase est une enzyme qui permet la phosphorylation du glucose en Glucose 6-Phosphate (sorte d'activation du glucose).


Glucokinase أنزيم الكليكوكيناز

Elle fonctionne en présence de Mg++, comme toutes les kinases.

L'hexokinase fixe le glucose et l'ATP pour former un complexe trnaire productif qui commence à donner les produit l'un après l'autre (ADP et Glucose 6-P). Les études enzymologiques montrent que la glucokinase fonctionne selon un mécanisme de catalyse ordonné (séquencé), où le glucose est le premier substrat qui sefixe et le Glucose 6-P est le dernier produit libéré.

Le glucose est attiré dans une 'poche' de l'enzyme appellée 'site actif'


Schéma de la glycolyse

glycolyse




Pyruvate حمض البيروفيك

Le pyruvate est décarboxylé dans la martice de la mitochondrie. L'acétate est transporté par le Coenzyme A (sous forme acétyl-Coenzyme A). L'acétate (2C) sera joint à l'oxaloacétate (4C) pour donner le citrate (6C) dans le cycle de Krebs.

فصم الكربون من حمض البيروفيك

يحدث تفاعل فصم الكربون من حمض البيروفيك داخل الميتوكندري بواسطة أنزيم بيروفات ديهيدروجيناز (Pyruvate déshydrogénase) الموجود بماتريس (Matrice) الميتوكندري وفق التفاعل الغير انعكاسي التالي:

Pyruvate transformé lors de la Glycolyse



Instructions pour la visualisation des molécules par JMOL تعليمات الاستعمال:

1. Choisir la molécule que vous voulez visualiser en la selectionnant dans les liens à droites اختر الجزيئ المراد معاينته 

2. Effectuer la ROTATION de la molécule en en pointant sur l'image et en maintenant appuyé le côté gauche de la souris tout en la faisant bouger. تحريك-دوران الجزيئ يتم بالضغط  مرتين مع استمرار الضغط  فوق الصورة مع تحريك الفأرة

3. Effectuer un ZOOM sur la molecule en maintenant enfoncée la touche shift (Î) du clavier et en tirant en avant et en arrière la sourisتقريب و إبعاد الصورة يتم بالضغط المتواصل على زر شيفت يمين لائحة المفاتح مع تحريك الفأرة

4. Pour avoir plus d'information sur la molécule, faite un clic droit par votre souris sur l'image et choisir, entre autres, le STYLE de visualisation. Ex: style -->combinaison--->bâtons.
للمعاينة تحت لوالب ألفا و صفائح بيتا، يجب إتباع نقر يمين الفأرة و اختيار -->style-->Combinaison-->Cartoon

5. Lorsque vous cliquez sur un atome de la molécule ses coordonnées (type d'atome, N°,..) s'inscrivent automatiquement sur la barre du bas de la page  عند وضع الفأرة فوق درة معينة من الجزيئ يظهر اسمها و رقمها

6. Pour savoir plus sur les commandes de visualisation tridimensionnelle des molécules du programme RASMOL s'appliquant aussi sur JMOL: visiter la page: http://www.takween.com/molecules-structure-3D/structures_preambule.html

7. Pour plus d'information sur JMOL, visiter: www.jmol.org

Javascript generated by a java program on 10 sept. 2007. Original page composed by J. Gutow 7/2006


- -
 

Glycolyse. Visualisation JMOL