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CELLULE. MATERIAUX BIOCHIMIQUES DE BASE
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SOMMAIRE

LA CELLULE ET LES MATERIAUX BIOCHIMIQUES DE BASE.....QCMcellule1....QCMliaisons.. . EXAMEN ...

1. QUELLES MOLECULES DANS LES ETRES VIVANTS ? ...... Exercices, QCM.

1.1. TYPES DE MOLECULES DANS LES ORGANISMES VIVANTS
1.1.1. Molécule à l'état de gaz
1.1.2. Molécules à l'état de solutions
1.1.3. Ensembles moléculaires à l'état solide
1.2. MOLECULES MINERALES
1.2.1. Métaux et
métalloïdes
1.2.2. Place des métaux et des métalloïdes chez les êtres vivants
1.3. MOLECULES ORGANIQUES

1.3.1. Squelette carboné
1.3.2. Fonctions chimiques.

2. AUTOASSOCIABILITE DES MOLECULES ET TENDANCE VERS LA COMPLEXATION .... Exercices,......QCMliaisons...

2.1. Forces électrostatiques
2.2. Forces de Van der waals
2.3. Liaisons hydrogène
2.4. Interactions hydrophobes

3. MATERIAUX BIOLOGIQUES DE BASE EN BIOCHIMIE

3.1. LIPIDES, DETERGENTS ET MEMBRANES BIOLOGIQUES
.... Exercices, QCM..
3.1.1.Acides gras,savons, acides gras essentiels
3.1.2. Glycérides, glycérophospholipides et sphingolipides
3.1.3. Structure des membranes biologiques
3.1.4. Lipides isopréniques (vitamines liposolubles, stéroïdes)


3.2. OSES, OSIDES ET GLUCIDES
... Exercices, QCM.
3.3. ACIDES AMINES PEPTIDES ET PROTEINES
... Exercices, QCM.
3.4. BASES AZOTEES ET ACIDES NUCLEIQUES
.... Exercices, QCM.
3.4.1. NUCLEOTIDE
3.4.2. DNA
3.4.3. RNA
3.5. TRANSPORTEURS D'ELECTRONS
...... Exercices, QCM...
3.6. TRANSPORTEURS DE GROUPEMENTS
...... Exercices, QCM...
3.7. VITAMINES ET MOLECULES ESSENTIELLES
.... Exercices, QCM...

SOMMAIRE

4. ORGANISATION DES MOLECULES DANS LES CELLULES ..... QCM & Examens

Les premières notions de Biochimie prennent la CELLULE végétale ou animale comme l'exemple de référence pour toutes les applications. Les molécules étudiées (PROTEINES, SUCRES, LIPIDES et ACIDES NUCLEIQUES) sont mémorisées par l'étudiant en sollicitant leur fonction au niveau de la cellule.

Ainsi, les membranes cellulaires à travers lesquelles se font les échanges avec le milieu extracellulaire, sont constituées surtout de lipides et de protéines qui sont parfois des enzymes. Au niveau du noyau cellulaire, l' acide désoxyribonucléique (DNA ) constitue le support de l'information génétique qui se tramsmet d'une génération à l'autre par division cellulaire (mitose). Le DNA est transcrit le RNA (ou ARN) qui lui même sera traduit en protéines.

4.1. PAROI CELLULAIRE

La paroi cellulaire est une caractéristique structurale de plusieurs êtres vivants dont les végétaux. Elle est constituée principalement de cellulose, hémicellulose, pectines, polymères phénoliques, protéines structurales et enzymatiques et différents ions.

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De nombreuses hydrolases (glucanases, pectine MethyleEstérase,...) sont présentes dans la paroi cellulaire. Leurs activités peuvent être modulées par l'environnement pariétal (pH, ions, ...).

Les oses constituent les éléments de base des polysaccharides de la paroi cellulaire. Ce sont des composés carbonés possédant des fonctions alcool et des fonctions réductrices (aldéhydes et céones). Il existe de nombreux isomères pour chacun des oses.

Plusieurs exemples peuvent être cités dont le GLUCOSE, le GALACTOSE, le MANNOSE. La cellulose est un enchaînement linéaire de glucose béta. Le monomère de base de la pectine, l'acide alpha-GALACTURONIQUE, est un dérivé du galactose par remplacement de la fonction alcool du C6 par une fonction acide. Ainsi, les pectines présentent des propriétés acides. Les hémicelluloses sont des polysaccharides qui peuvent s'associer aux pectines ou à la cellulose (cas des hémicellulose de type xyloglucanes).

Les lignines font également partie des constituants des parois cellulaires. Elles contiennent des unités phénylpropane variées (alcools coumarylique, coniférylique, synapylique,…) reliées entre elles en structure tridimensionnelle complexe rendant difficile la croissance.

4.2. MEMBRABE PLASMIQUE

La membrane plasmique est constituée de lipides et de protéines. Les lipides membranaires sont des phospholipides présentant un pôle hydrophile (soluble dans l'eau) et un pôle hydrophobe.

Les phospholipides sont disposés en 2 couches, avec des parties hydrophobes en vis à vis. Les protéines hydrophiles sont fixées aux pôles hydrophiles des lipides. Les protéines hydrophobes sont fortement liées aux lipides (integration).

4.3. CYTOPLASME
4.4. NOYAU CELLULAIRE

4.5. RETICULUM ENDOPLASMIQUE

Le réticulum endoplasmique est un ensemble de cavités de formes variées. La face hyaloplasmique des cavités peut être couverte de petits grains; les RIBOSOMES. Le réticulum est dit granuleux. Sinon, il est dit lisse. Les ribosomes sont impliqués dans la synthèse des chaînes polypeptidiques.

Ils décodent le message porté par le RNA messager. Les chaînes polypeptidiques traversent les membranes et sont libérées dans les cavités

4.6. APPAREIL DE GOLGI
4.7. MITOCHONDRIE
La mitochondrie (M) est un organite cellulaire à enveloppe formée de 2 membranes. La membrane interne forme des plis (crêtes. L'interieur de la mitochondrie est constitué d'une substance (matrice) contenant du DNA, du RNA, des protéines,..

La mitochondrie est le site des réactions d'oxydation de la respiration. Il en résulte une production d'énergie stockée sous forme d'ATP.

4.8. CHLOROPLASTES
Grace à ses pigments, le chloroplaste (CH) transforme l'énergie lumineuse en énergie chimique permettant la synthèse des glucides.

4.9. INCLUSIONS, LYSOSOME ET PEROXYSOME

QUELLES RELATIONS METABOLIQUES EXISTENT ENTRE LE CYTOPLASME (HYALOPLASME) ET LA MITOCHONDRIE ?

Après digestion des grosse molécules polymériques provenant des aliments (protéines, polysaccharides et lipides), il résulte des sous-unités monomériques correspondant respectivement aux aminoacides, sucres simples (ex.glucose) et acides gras + glycérol.

Les petites molécules rentrent dans le CYTOPLASME et subissent encore une dégradation plus poussée. Les sucres simples sont convertis en PYRUVATE (GLYCOLYSE. Il y'a, en même temps, une production limitée d'ATP et de NADH ((pouvoir réducteur).

Le pyruvate rentre dans la mitochondrie. Il sera transformé en groupements acétyle d'un composé chimiquement actif; l'ACETYL COENZYME A (Acétyl CoA). D'autres quantités d'acétyl CoA résultent de l'oxydation des acides gras.

Toujours dans mitochondrie, le groupement ACETYL de l'acétyl CoA est complètement dégradé en CO2 et en H2O. Cette oxydation entraine la production d'une grande quantité de NADH qui donne plusieurs ATP suite à un transport d'éléctrons (e-). Il existe environ 1 milliard de molécules d'ATP par cellule typique. Elles serviront pour produire de l'énergie nécessaire pour d'autres réactions suite à leur hydrolyse en ADP et phosphate.

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