Biochimie, biotechnologies

Visualisation 3D par JMOL des molécules et enzymes de la glycolyse. Production du glucose-6-phosphate par action de l'hexokinase.
جزيئات انحلال الجلوكوز. معاينة في البعد الثالث


glycolyse, glucose-6-phosphate, hexokinase

Glycolyse . Production du glucose-6-phophate par l'hexokinase. Visualisation 3D par JMOL
جزيئات انحلال الجلوكوز. معاينة في البعد الثالث


Le schéma de la glycolyse est montré ci-dessus. Il montre l'action de plusieurs enzymes sur des substrats comme le glucose pour générer des produits comme le pyruvate sui sont importants dans la production de l'énergie sous forme d'ATP.
La visualisation en 3D par JMOL des molécules et enzymes de la glycolyse permet de contribuer à la compréhension de la production de l'énergie par la cellule.
Il convient de noter deux grandes étapes marquant la glycolyse:
- l'activation du glucose par phosphorylation et production du glucose-6-phosphate (par action de l'enzyme hexokinase) et fructose 1,6-diphosphate (Fructose 1,6-bisphosphate)
- Oxydation des triose- phosphate accompagnée de la libération de coenzymes réduits (NADH), pouvoir réducteur pour la production de l'ATP


ما هي أهم مراحل انحلال الجلوكوز داخل الجبلة الشفافةو ظهور حمض البيروفيك - Acide pyruvique
تنشيط الجلوكوز في شكل فروكتوز 1، 6- ثنائي الفوسفاط و الذي سينشطر إلى جزيئين من سكر ثلاثي الكاربون مفسفر.
- أكسدة جزيئا السكر ثلاثي الكاربون المفسفر إلى جزيئين من حمض البيروفيك. و تستعمل الطاقة المحررة من هذه الأكسدة في فسفرة ADP إلى ATP. تفاعل اكسدة اختزال (Oxydoréduction) هو عبارة عن إزالة الهيدروجين (Déshydrogénation)، و يتطلب مستقبل للهيدروجين و هو NAD+ (Nicotinamide Adénine Dinucléotide) الذي يختزل في صفة NADH (+ H+) و الذي يعتبر كطاقة اختزالية للخلية (Pouvoir réducteur)، بينما يتأكسد سكر ثلاثي الكربون (يفرغ من 2 H+ و 2 e-). المزيد من المعلومات في كتاب بنيات و استقلاب السكريات


Glucose جلوكوز


La glycolyse se déroule dans le cytoplasme et aboutit à la formation de deux molécules de pyruvate (3 carbones) à partir d'une seule molécule de glucose (6 carbones). Le bilan global de la glycolyse est :
Glucose + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD+ ----> 2 pyruvate + 2 ATP + 2 H2O + 2 NADH
La glycolyse comprend deux étapes principales dont:
1/ La phosphorylation (consommatrice d'énergie) et
2/ La déshydrogénation ou oxydation s'accompagnant de la production d'énergie sous forme d'ATP.
Le glucose sera d'abord phosphorylé par fixation du phosphate sur son carbone N° 6. Il en résulte le Glucose 6-phosphate. La glucokinase (ou hexokinase) joue un rôle capital. Le glucose-6-P est ensuite transformé en Fructose 6-P qui est phospholylé une deuxième fois sur son carbone 1 pour donner le Fructose-1,6-diphosphate (voir schéma de la glycolyse).





C'est le glucose qui est le premier acteur dans la glycolyse et la production d'énergie sous forme d'ATP (part du catabolisme dans le métabolisme).


Fructose-6-phosphate فريكتوز 6-فوسفاط


Pendant la glycolyse, le fructose-6-phosphate est phosphorylé en Fructose-1,6-diphosphate (Fru-1,6-DP) par la phosphofructokinase-1 en utilisant une molécule d'ATP qui est convertie en ADP. Cette consommation d'énergie rend cette étape irréversible, et constitue un point de régulation de la vitesse de la glycolyse (voir schéma de la glycolyse).




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Hexokinase (Glucokinase)
إنزيم الهيكزوكيناز


L'hexokinase ou glucokinase est une enzyme qui permet la phosphorylation du glucose en Glucose 6-Phosphate (sorte d'activation du glucose). Elle fonctionne en présence de Mg++, comme toutes les kinases.
L'hexokinase fixe le glucose et l'ATP pour former un complexe ternaire productif qui commence à donner les produit l'un après l'autre (ADP et Glucose 6-P). Les études enzymologiques montrent que la glucokinase fonctionne selon un mécanisme de catalyse ordonné (séquencé), où le glucose est le premier substrat qui sefixe et le Glucose 6-P est le dernier produit libéré.
Le glucose est attiré dans une 'poche' de l'enzyme appellée 'site actif'


Le glucose phosphorylé sous forme de glucose-6-phosphate ne peut pas quiter la cellule sous cette forme. Pour passer dans le sang, il faut qu'il soit déphosphorylé par une enzyme la glucose-6-phosphatase (voir la néoglucogenèse).


Pyruvate - الحمض البيروفي


Le pyruvate est décarboxylé dans la martice de la mitochondrie. L'acétate est transporté par le Coenzyme A (sous forme acétyl-Coenzyme A). L'acétate (2C) sera joint à l'oxaloacétate (4C) pour donner le citrate (6C) dans le cycle de Krebs. Cette décarboxylation est assurée par une enzyme de la matrice mitochondriale appellée pyruvate déshydrogénase.

فصم الكربون من حمض البيروفيك

يحدث تفاعل فصم الكربون من حمض البيروفيك داخل الميتوكندري بواسطة إنزيم بيروفات ديهيدروجيناز (Pyruvate déshydrogénase) الموجود بماتريس (Matrice) الميتوكندري وفق التفاعل الغير انعكاسي التالي:

Pyruvate transformé lors de la Glycolyse



LIENS UTILES


- ملخص للدروس المتعلقة باستهلاك المادة العضوية وتدفق الطاقة
Résumé des leçons relatives à la consommation de la matière organique et flux d'énergie

- Glycéraldéhyde-3-Phosphate Déshydrogénase (GPDH)
- Fermentation (alcoolique et lactique) des sucres (Exercice)
- Glucides (sucres). Structure 3D
- Matériaux biologiques de base dans l'édification des êtres vivants (Arabe)
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