La réussite de l'extraction et la purification de l'ADN, méthode au CTAB (استخلاص و تنقية الحمض النووي الريبوزي ناقص الأكسيجين) est liée à l'élimination du maximum des protéines (+ polyphénols + polysaccharides chez les plantes) de l'extrait tout en maintenant un ADN non altéré par les DNases. Le degré de purification est évalué par le rapport DO260/DO280
QUESTION1. Il
est facile d'extraire et purifier l'ADN d'une bactérie que
l'ADN de la courge, parce que : -cocher la réponse juste-:
(!L'ADN des bactéries est petit et circulaire
et associé à des histones en quantité faible)(L'ADN
de la courge est associé aux histones)(!L'ADN
des plantes se dénature rapidement)(!L'ADN
des bactéries est riche en introns)
QUESTION 2. Le
rôle de l'azote liquide dans les extractions et purification
de l'ADN à -choisir une seule réponse-
(!Attaque mécanique et chimique du matériel
biologique)(!Lyse chimique du matériel
biologique)(Attaque mécanique du matériel
biologique)(!Conservation de l'ADN contre l'action
des DNases)
QUESTION 3. Il
est facile d'extraire et purifier l'ADN des folioles de palmier dattier
que l'ADN du thymus de veau-choisir une seule réponse-
(!C'est vrai, car les folioles de palmier dattier contiennent
peu d'ADN)(!C'est vrai, car le thymus ne contient
pas d'autres sources de l'ADN, comme l'ADN chloroplastique)(!C'est
faux, car l'ADN des plantes est entouré par de nombreuses histones)(C'est
faux, car l'extrait d'ADN des plantes est associé aux histones,
polyphénols et polysaccharides)
QUESTION 4. Le(s)
critère(s) d'une solution d'ADN bien purifié est (sont):-choisir
une seule réponse-
(!Contenu riche en ADN non altéré et
en protéines associées)(!Contenu
riche en ADN peu importe son état de conservation)(!Contenu
riche en ADN peu importe son état mais avec très peu
de protéines)(!Contenu riche en ADN non
altéré avec des protéines dénaturées)(Contenu
riche en ADN non altéré avec très peu de protéines)
QUESTION 5. Par
rapport aux enzymes, l'extraction et la purification de l'ADN nécessite
l'emploi de matériel biologique frais ou conservé à
températures basses -cocher la réponse juste-:
(!C'est vrai, car l'ADN peut être facilement
dénaturé)(!C'est vrai, car les
enzymes et l'ADN sont toutes des molécules fragiles)(C'est
faux, car l'ADN est résistant à la dénaturation
par rapport aux enzymes)(!C'est faux, car l'ADN
bicaténaire se transforme facilement en ADN monocaténaire,
lors de la purification)(!C'est vrai, car les
enzymes sont plus résistantes à l'hydrolyse, lors de
la purification)
QUESTION 6. Le rôle de la basicité élevée du tampon d'extraction et la purification de l'ADN des plantes est: -cocher deux réponses justes-: (! Contribution à l'élimination des polyphénols et des polysaccharides)(!Acquisition d'une charge positive aux histones pour faciliter leur séparation)(Neutralisation de la charge électrique des histones de point isoélectrique égal au pH du tampon d'extraction de l'ADN et affaiblissement de l'interaction ADN-histones)(! Contribution à la déstruction des structures lipidiques membranaires )( Contribution à l'inactivation des DNases)
QUESTION 7. Le rôle de EDTA dans l'extraction et la purification de l'ADN des plantes est : -cocher la réponse juste- (!Fixation des ions divalents pour bloquer l'activité des kinases)(!Adsorption et précipitation des polyphénols)(! Contribution à la dénaturation des protéines)(Fixation des ions divalents pour bloquer l'action des DNases)(!Affaiblissement de l'interaction histones-ADN)
QUESTION 8. Le
rôle du CTAB (Cetyl
trimethylammonium bromide) dans l'extraction et la purification
de l'ADN des plantes est: -cocher une seule réponse -
(!Fixation des ions divalents pour bloquer l'action
des DNases)(Rupture des structures lipidiques
au niveau des membranes et complexation avec l'ADN et les polysaccharides)(!Dénaturation
des protéines pour faciliter leur solubilisation)(!Solubilisation
des protéines)
QUESTION 9. Le rôle des concentrations élevées en sels (comme NaCl) dans l'extraction et la purification de l'ADN des plantes est: -cocher la réponse juste-(Affaiblissement de la liaison ionique entre l'ADN et les protéines par compétitivité aux molécules d'eau entre les sels et les protéines)(!Rupture des structures membranaires)(!Elimination des polyphénols et polysaccharides)(!Stabilisation de l'ADN)
QUESTION 10. Le rôle du mélange chloroforme-alcool isoamylique dans l'extraction et la purification de l'ADN des plantes est : -cocher la réponse juste-(!Précipitation de l'ADN à -20°C)(!Formation de phases pour récupérer l'ADN dans l'interface)(Formation de phases pour récupérer l'ADN dans la phase aqueuse)(!Formation de phases pour récupérer l'ADN dans la phase organique)(!Séparation de l'ARN copurifié avec l'ARN)
QUESTION 11. Le caractère moussant du tampon d'extraction est dû à : -cocher la réponse juste-(!Mercaptoéthanol)(!EDTA + Mercaptoéthanol)(CTAB)(!EDTA + NaCl 1,4 M)
QUESTION 12. Choisir l'information fausse concernant les étapes d'extraction et de purification de l'ADN des plantes: -cocher la réponse juste-(!Les acides nucléiques sont solubles dans l'eau pure et dans les solutions aqueuses à faibles concentrations en sels)(!Les acides nucléiques sont précipités par l'isopropanol ou par le mélange éthanol et sels)(!Les protéines sont solubles dans les solvants organiques comme le chloroforme)(Les protéines sont solubles dans les solutions aqueuses à concentrations élevées en sels)
QUESTION 13. Choisir
l'information fausse concernant l'évaluation de la pureté
de l'ADN purifié à partir d'une plante: -cocher la réponse
juste-
(!Les protéines présentent un pic d'absorption
maximal à 280 nm)(!Ce sont les bases
azotées qui donnent l'absorption de l'ADN à 260 nm)(La
recherche de contamination des acides nucléiques par des protéines
s'effectue en mesurant le rapport DO à 280 nm sur DO à
260 nm. Celui-ci doit être de l'ordre de 1,8 - 2,0 pour une
pureté optimale)(!Le rapport DO à
260 nm sur DO à 280 nm de l'ordre de 1,8 - 2,0 renseigne sur
une purification meilleure de l'ADN)
QUESTION 14. Choisir
l'information fausse relative aux composés chimiques CTAB
(voir image ci dessus) et SDS
(voir image) souvent utilisés dans la purification
de l'ADN: -cocher la réponse juste-
(!Par des interactions hydrophobes avec les structures
lipidiques, CTAB et SDS entrainent la ruptures des membranes)(par
sa 'tête', SDS se lie à l'ADN)(!par
sa charge électrique positive, CTAB se lie à l'ADN)(!CTAB
et SDS sont des agents moussants)
QUESTION 15. Choisir l'information correcte concernant le rôle du béta-mercaptoéthanol dans la purification de l'ADN des plantes: -cocher la réponse juste-(!Rupture des structures membranaires et précipitation de l'ADN)(!Elimination des polysaccharides qui empêchent l'action des enzymes de restriction sur l'ADN, une fois purifié)(Protection contre l'oxydation des phénols en tanins se liant de façon covalente à l'ADN et dénaturation des protéines par réduction des ponts dissulfures)(!Inhibition des DNases pouvant altérer l'ADN au cours de la purification par coupure des ponts dissulfures)
QUESTION à cases vides.
Concernant la purification de l'ADN des plantes. Remplir les cases vides par des mots ou des chiffres (écrire en MAJUSCULES et respecter les espaces)
Pour la vérification des réponses, remplir toutes les cases, d'abord
1/ La lyse chimique nécessite : MILIEU BASIQUE (choix: ETHANOL, ISOPROPANOL, MILIEU ACIDE, MILIEU BASIQUE, 37°C).
2/ Le CTAB, étant un: DETERGENT CATIONIQUE (choix: SEL, ACIDE, DETERGENT ANIONIQUE, DETERGENT CATIONIQUE, BASE FAIBLE),
3/ il agit sur les:LIPIDES (choix: GLUCIDES, LIPIDES, PROTEINES, POLYSACCHARIDES, PHENOLS).
4/ L'addition de l'isopropanol sur une solution d'ADN empêche son
interaction avec les molécules de :EAU (choix: SEL, EAU, CTAB, SDS, MERCAPTOETHANOL)
5/ Il en résulte une :PRECIPITATION (choix: DENATURATION, HYDROLYSE, OUVERTURE, PRECIPITATION, DISTORTION)
6/ Lors de la purification de l'ADN, le rapport DO à 260 sur DO à 280 nm supérieur à 2, signifie la présence de :ARN (choix: ADN PUR, ARN, PROTEINES, ADN+PROTEINES)
DETAILS DES REPONSES
Q[1]: L'ADN DES
BACTERIES EST NU (SANS PROTEINES). DETAIL DANS PAGES 81-86 DU LIVRE
'SCIENCES DE LA VIE-BIOCHIMIE', M. BAAZIZ
Q[2]: AZOTE LIQUIDE (T= -195,79°C): DESSECHE LE MATERIEL BIOLOGIQUE
ET ASSURE UNE ATTAQUE MECANIQUE
Q[3]: ADN DES PLANTES CONTIENT EN PLUS DES POLYPHENOLS ET DES POLYSACCHARIDES
Q[4]: PURIFICATION OPTIMALE DE L'ADN: EXTRAIT RICHE EN ADN ET TRES PAUVRE
EN PROTEINES
Q[5]: GL'ADN EST RESISTANT A LA DENATURATION. IL PEUT ETRE EXTRAIT A
PARTIR DE MATERIEL SEC ET LONGUEMENT CONSERVE
Q[6]: PH ELEVE PROCHE PI DES HISTONES NEUTRALISE LA CHARGE + DES HISTONES.
DETAIL:PAGE 100 DU LIVRE 'SCIENCES DE LA VIE-BIOCHIMIE', M. BAAZIZ
Q[7]: EDTA FIXE MG++ ET BLOQUE L'ACTIVITE DES DNASES QUI ALTERENT L'ADN
Q[8]: CTAB: DETERGENT CATIONIQUE (+) DETRUIT LES STRUCTURES LIPIDIQUES
DES MEMBRANES ET FIXE LES POLYSACCHARIDES ET SE COMPLEXE AVEC L'ADN
Q[9]: SELS A CONCENTRATION ELEVEE: PRECIPITENT LES PROTEINES
Q[10]: MELANGE CHLOROFORME-ALCOOL ISOAMYLIQUE: PERMET LA FORMATION DES
PHASES
Q[11]: CTAB = DETERGENT CATIONIQUE MOUSSANT COMME LES AUTRES DETERGENTS
(SDS, TRITON X100, ..
Q[12]: LES PROTEINES PRECIPITENT A CONCENTRATIONS ELEVEES EN SELS
Q[13]: PURETE DE L'EXTRAIT D'ADN MESUREE PAR LE RAPPORT DO260/DO280
DEVANT ETRE PROCHE DE 2
Q[14]: PAR SA TETE CHARGEE NEGATIVEMENT SDS NE PEUT PAS SE FIXER SUR
L'ADN, DE MEME CHAGE (-). AUSSI EN CHARGEANT LES PROTEINES NEGATIVEMENT,SDS
PERMET LEUR DETACHEMENT DE L'ADN
Q[15]: BETA-MERCAPTOETHANOL, AGENT REDUCTEUR, EVITE L'OXYDATION DES
PHENOLS EN TANINS QUI SE FIXENT SUR L'ADN DE FACON COVALENTE. EN PLUS,
IL DENATURE LES PROTEINES PAR RUPTURE DES PONTS S-S
Liens utiles:
- Extraction et purification de l'ADN des plantes (TP S5)
- DNA electrophoresis
- Electrophorèse de l'ADN
des plantes (TP S5). QCM
- QCM électrophorèse, supports de migration
- Acides nucléiques. quantification
- QCM Chromatographie,
Electrophorèse
- QCM Nucléosides
& Nucléotides
- Purification, analyse DNA
du plasmide. Contrôle TP 2015
- Biologie
moléculaire. Examen TP S5 2016
- Contrôle (Examen)
de TP Biologie moléculaire, 2019
- DNA electrophoresis
on agarose gel
Takween. Supports
Chaine Youtube
(abonnement). Plusieurs vidéos multilingues
Enseignements par semestres
ANNONCES, INFORMATIONS
Congrès,
Conférences,...
- Congrès, Conférences
- Cours, Workshops
- Bourses, Postdocs
- Biotech-ecolo annonces
CONCOURS:
-
تحميل ملفات في مواضيع البيوكيمياء
Téléchargement de fichiers en Biochimie
مجلة
إخبارية - Newsletter
Concentrations.Vidéos
explicatives
Afin de pouvoir continuer à servir les visiteurs, soutenez nos actions sur le site takween en faisant acquisition des ouvrages et supports pédagogiques desitinés à améliorer l'enseignement et la recherche scientfique en Biochimie.