Biochimie et biotechnologies

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Molécules du cycle de Krebs. Visualisation tridimensionnelle
جزيئات حلقة كريبس. معاينة في البعد الثالث

Après décarboxylation du pyruvate en acétate (intervention de la pyruvate déshydrogénase, coenzyme A et NAD+), le cycle de Krebs, se déroulant dans la matrice des mitochondries, permet la destruction de l'acétate (véhiculé sous forme d'acétyl-coA), la production CO2 et production d'une molécule d'ATP et un pouvoir réducteur constitué de 3 molécules de NADH et 1 FADH2. La visualisation 3D par JMOL des molécules (4C-6C) et des enzymes du cycle de Krebs, contribue à la compréhension des phénomènes de production d'énergie dans la cellule.

يتجلى دور حلقة كريبس (في ماتريس الميتوكندري) في خلق جزيئات وسيطة لإنتاج ATP في المراحل اللاحقة من التنفس. المرحلة الأولى لحلقة كريبس تكمن في نقل الأستيل (شكل C2) فوق حمض الأكسالوأستات (Acide oxaloacétique) ذو 4 ذرات من الكاربون ليعطي حمض السيتريك (شكل C6). أما المرحلة الأخيرة، فتنتج من جديد حمض الأكسالوأستات ليتفاعل من جديد مع الأستيل و يبدأ دورة أخرى (أنظر الرسم التالي).

ينتج عن دورة كريبس الهدم الكلي للأستيل المرتبط سابقا بالأستيل كوأنزيمA   مع تعويض لحمض الأكسالوأستات الضروري لإعادة دورة جديدة. تتميز كل دورة كريبس بنتيجتين:

-         فصم الكاربون و تحرير ثاني أكسيد الكربون CO2.

-         إزالة الهيدروجين عن طريق اختزال المستقبلات و FAD+ NAD+، إذ تصبحا بالتتالي، NADH, H+ و FADH2.

-         تخليق جزيئة ATP(أو GTP، عند الحيوانات). المزيد من المعلومات  في كتاب علوم الحياة - بيوكيمياء 

Plus de détails dans le livre 'Sciences naturelles-Biochimie'

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Sciences et vie, Biochimie


Acétyl-Coenzyme A

L'acétyl-Coenzyme A est la forme Coenzyme A (transporteur de groupes acétyl) à laquelle est fixé l'acétyl qui provient du pyruvate qui se trouve décarboxylé (voir structure ci dessous). Lien comparaison NAD, FAD, ATP et Acétyl-coenzyme A

فصم الكربون من حمض البيروفيك

يحدث تفاعل فصم الكربون من حمض البيروفيك داخل الميتوكندري بواسطة أنزيم بيروفات ديهيدروجيناز (Pyruvate déshydrogénase) الموجود بماتريس (Matrice) الميتوكندري وفق التفاعل الغير انعكاسي التالي:


pyruvate déshydrogénase
La béta-alanine, acide aminé non protéinogène, intervient dans la structure du Coenzyme A, car faisant partie de la vitamine B5. La Coenzyme A joue le rôle d'un transporteur de groupement acétyl.

Coenzyme A


Acide citrique

L'acide citrique (acide en C6) intervient dans le cycle de Krebs (= cycle de l'acide citrique). C'est un intermédiaire du métabolisme des organismes aérobies. L'acide citrique est formé au cours du cycle de Krebs, par condensation de l'acétate (transporté par d'acétyl-CoA) et d'oxaloacétate en présence de la citrate synthétase (voir schéma du cycle de Krebs).



La FAD est un cofacteur d'oxydo-réduction (transporteur de protons H+) dérivant de la riboflavine (vitamine B2). Il est associé par une liaison covalente aux enzymes de la classe des oxydo-réductases. FAD est donc un groupement prosthétique.


FAD (Flavine Adénine Dinucléotide)

Il est utilisé comme coenzyme par les flavoprotéines du complexe II de la chaîne respiratoire mitochondriale (Glycérol 3-P déshydrogénase, AcylCoA déshydrogénase, Succinate déshydrogénase). Lien comparaison NAD, FAD, ATP et Acétyl-coenzyme A.

FAD


Cycle de Krebs. Schéma

Cycle de Krebs - molécules. Voir visualisation 3D


ATP, NAD, FAD & Acétyl-Coenzyme A. Structure et fonction (Ar):

ATP, NAD, FAD & Acétyl-Coenzyme A. Structure et fonction (Fr):


JMOL, Rastop:معاينة جميع الجزيئات ب


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