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enzymologie, enzymes, mécanismes catalyse

Enzymologie; enzymes. Mécanismes catalyse des réactions enzymatiques à plusieurs substrats. Cours 3



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ENZYMOLOGIE. ENZYMES A PLUSIEURS SUBSTRATS. INTRODUCTION

MECANISMES CATALYSE DES REACTIONS ENZYMATIQUES A DEUX SUBSTRATS

TYPES DE MECANISMES DE CATALYSE A DEUX SUBSTRATS

FAIRE DES EXERCICES SUR L'ENZYMOLOGIE A DEUX SUBSTRATS

TRAVAUX PRATIQUES SUR L'ENZYMOLOGIE A DEUX SUBSTRATS

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ENZYMOLOGIE A PLUSIEURS (2) SUBSTRATS
إنزيمولوجيا بركائز متعددة


De façon générale, la catalyse par enzymes implique deux substrats. Dans les réactions, souvent, on fait abstraction du deuxième substrat qui peut être de l'eau (H2O) pour les réactions d'hydrolyse ou un donneur ou un accepteur d'électrons pour les réactions d'oxydoréduction (coenzyme libre). Les questions qui se posent, sont: 1/ dans quel ordre les substrats s'engagent dans la réaction enzymatique?, 2/ Quels complexes enzyme substrats sont formés (binaires et/ou ternaires)? et 3/ Quels changements éventuels affectent l'enzyme (exemple, formation d'enzyme transitoire)?. De ce fait, en enzymologie approfondie, il existe plusieurs mécanismes de catalyse des réactions enzymatiques à deux substrats (mécanismes catalyse 2S). On peut citer 1/ des mécanismes aléatoires (au hasard), sans aucun ordre, ni dans la fixation des substrats, ni dans la libération des produits, 2/ mécanismes ordonnées (séquencés) avec un substrat directeur de la catalyse et 3/ mécanismes ne formant jamais de complexes ternaires enzyme-substrats et où la fixation d'un substrat entraine la libération d'un produit correspondant avant la fixation du second substrat et libération du dernier substrat. Ce sont des mécanismes 'ping-pong'. L'image ci-contre récapitule les principaux mécanismes de catalyse des réactions enzymatiques à deux substrats

بشكل عام، يتضمن التحفيز الإنزيمي ركيزتين. في التفاعلات، غالبًا ما نتجاهل الركيزة الثانية والتي يمكن أن تكون الماء (H2O) لتفاعلات التحلل المائي أو مانح أو متقبل للإلكترون لتفاعلات الأكسدة والاختزال. الأسئلة التي تطرح هي: 1/ في أي ترتيب تشارك الركائز في التفاعل الأنزيمي؟، 2/ ما هي معقدات الإنزيم والركيزة التي تتشكل (ثنائية و/أو ثلاثية)؟ و 3/ ما هي التغييرات المحتملة التي تطال الإنزيم نفسه (على سبيل المثال، تكوين إنزيم عابر)؟ لذلك، في علم الإنزيمات المتعمق، هناك عدة آليات لتحفيز التفاعلات الأنزيمية ثنائية الركيزة. يمكننا أن نستشهد بـ 1/ ميكانزمات عشوائية، دون أي ترتيب، لا في تثبيت الركائز، ولا في إطلاق النواتج، 2/ ميكانزمات مرتبة (متسلسلة) مع ركيزة توجه التحفيز و 3/ ميكانزمات يغيب فيها تشكيل معقدات ثلاثية إنزيم-ركيزة وحيث يؤدي تثبيت الركيزة الأولى إلى إطلاق الناتج المقابل، قبل تثبيت الركيزة الثانية وإطلاق الناتج الأخير و تسمى هذه الميكانزمات ب "بينج بونج". تلخص الصورة أعلاه، الميكانزمات الرئيسية للتحفيز الانزيمي باستخدام ركيزتين


- Lire les pages web disponibles sur le site takween (voir les liens dans le cadran gauche de cette page). Ces pages illustrent les différents types de mécanismes de catalyse montrés par les enzymes et les moyens de les mettre en évidence en enzymologie. Des exemples d'enzymes sont choisis pour chaque situation. Ce cours traduit en Arabe (avec extraits en Français) a fait l'objet d'un ouvrage dont il est conseillé de lire.
Sommaire détaillé -تحميل الفهرس المفصل


ENZYMOLOGIE. MECANISMES CATALYSE 2S


Mécanismes de catalyse enzymatique à deux substrats. Généralités
Moyens de détermination des mécanismes de catalyse des réactions enzymatiques à plusieurs substrats.
--> Utilisation des analogues de substrats.
--> Utilisation des modes d'inhibition par les produits de la réaction (Règles de Cleland, 1963).
--> Utilisation d'autres méthodes. Exemple de la Dialyse à l'équilibre.


ENZYMOLOGIE. PRICIPAUX TYPES DES MECANISMES DE CATALYSE.


--> principaux types de mécanismes de catalyse des réactions à deux substrats.
--> Mécanismes de catalyse aléatoires
----> Mécanisme de catalyse au hasard, fixation dépendante.
----> Mécanisme de catalyse au hasard, fixation indépendante.
--> Mécanismes de catalyse ordonnés
-----> Mécanismes séquencés.
-----> Mécanismes Theorell-Chance.
--> Mécanismes Ping-Pong
Ping-pong mécanisme

FAIRE DES EXERCICES SUR L'ENZYMOLOGIE A DEUX SUBSTRATS.


- Faire les exercices des exercices portant sur la détermination des mécanismes de catalyse des réactions enzymatiques à plusieurs substrats..
- Exercices sur les méanismes de catalysesdes enzymes telles que l'hexokinase et la CoA transférase


PRENDRE NOTE DES TRAVAUX PRATQUES


Lien TP (Enseignement en présentiel):
- Cinétique et mécanisme de catalyse des peroxydases des plantes
- TP peroxydase (texte)
- Structure 3D des peroxydases
- Peroxydases des plantes. Conférence Baaziz

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